珠江船務發展有限公司成立於1996年9月，業務包括船舶代理、內河貨物直運及轉運、碼頭貨物處理(包括中流作業)、貨物拼裝、倉儲及集裝箱陸路運輸等。1997年5月，公司於香港聯交所上市。公司為珠江船務企業(集團)有限公司控股的香港上市公司，隸屬於廣東省航運集團有限公司旗下。
珠江船務企業(集團)有限公司成立於1962年，是廣東省航運集團有限公司屬下全資子公司。廣東省航運集團有限公司是廣東省省屬重點大型企業集團之一，主要經營廣東省內貨物及旅客運輸、倉儲、船舶修造及其他相關業務。
公司在珠江三角洲擁有15家內河碼頭股權，33個集裝箱代理點，17個散雜貨代理點，經營35條粵港集裝箱航線和18條散貨航線，為粵港內河航運市場的龍頭企業。
公司核心業務為港口航運物流和高速客運。港口物流方面，在內地成立了物流事業部，加強與大船公司、樞紐港合作，如高明港通過與國際大船公司合作，外貿集裝箱創出歷史新高，成為西江流域外貿集裝箱量最大的二類口之一，並積極開拓合約物流，如西域港積極開展凍品業務。客運方面，經營珠江三角洲往來香港和中國客運碼頭、港澳碼頭的市區航線和往返香港國際機場海天客運碼頭的機場航線，加強與旅遊業務的合作，從傳統交通運輸轉型為向旅遊客運服務，成功擴展粵港航線與港澳航線的聯遊產品。
2010年收購控股股東－珠江船務企業(集團)有限公司的客運資產後，又達成了資產置換的協議，將高速公路此一非主營業務剝離，並持續收購控股股東的港口資產，提升核心競爭力。
2011年2月，收購珠江海空聯運有限公司剩餘49%股權，成為公司全資附屬公司。
公司與珠江船務企業達成協議，自2011年7月起，珠江船務企業將與港口航運物流及高速客運相關的八家公司資產以委託管理方式交由公司管理。
2013年6月，公司更名為珠江船務企業(股份)有限公司。
