分區將磁碟機切割為一個或數個邏輯區域,每個分區都有自己的檔案配置表來對映到分區內的檔案配置情形。 目前的MS-DOS與其相容的作業系統,受限於它的16位元FAT的定址限制,每個分區的最大容量為2GB。當硬碟機儲存容量超過2GB時,可以選擇是否用32位元的FAT來分區硬碟機,不過無法對16位元的FAT程式提供逆相容的能力,也就是說以前的舊檔案無法在新的作業系統﹝硬碟機﹞上執行。