合庫設立於中華民國三十五年十月五日，係由台灣省政府接收前日據時代台灣產業金庫，將合作事業團體、農會、漁會、農田水利會等社股組織而成，名為合作金庫，至民國九十五年始更名為合作金庫商業銀行，並於同年併入農民銀行。公司海內外超過300家分行，為國內擁有最多分行之商業銀行。而依總資產排名，在國內為僅次台灣銀行之第二大行庫。
2011年合作金庫成立金控，於12月1日正式上市交易，股票代號為「5880.TW」，合作金庫商業銀行股票並轉換為合庫金控股票，同日合庫(5854.TW)股票終止上市。
合庫放款餘額達1.7兆元，其中企金與消金比重為63:37 ，企金放款結構中民營放款6,230 億元，中小企業放款3,180 億元，而消金放款中房屋貸款4,500億元，根據銀行法規定，房貸承作上限為30%，合庫約為28%。
合庫2007年底存放利差約1.25%，受惠於央行升息使得指數型房貸利率上揚，預估2008年存放利差可擴大至1.3%。
資產品質方面，2007年底逾放比降至1.7% ，呆帳覆蓋率升至52% ，資產品質轉佳。
土地資產方面，合庫帳上土地餘額約220 億元，分別於民國六十八年與八十四年資產重估，由於合庫有多筆土地、商用大樓位於北市精華區，包括台北館前大樓、鄰近國父紀念館的忠孝東路分行、自強大樓與松山區敦化段土地等。
2010年4月合庫與法國巴黎巴黎控股保險控股公司(BNP Paribas Assurance)合資成立「合庫人壽」，在全台301家分行據點銷售，全年保費目標200億元。
大陸銀監會於2010年9月16日宣布核准合作金庫籌設大陸分行，據點設於蘇州，預計年底前可正式開業。為增加蘇州分行的營運利基，合庫分別與大陸國有銀行的總行、分行協商策略聯盟案，金管會放行之後，農業銀行、工商銀行兩大國有銀行將是第一波與合庫簽署策略聯盟的陸銀。
合庫預計於2010年9月24日進行總部大樓改建，樓地板面積共達32,000多坪，落成之後的總市值上看200億元，預計將在民國103年2月完工。
合作金庫銀行預計在2011年底前成為第16家金控，以合庫近新台幣3兆元資產規模，將躋身為第四大金控，金控成立後，第一階段，證券部門將獨立成立證券子公司，資產管理公司將提升至子公司，並有票券子公司；第二階段再將人壽及投信，從孫公司轉成子公司。籌設證券子公司案也已送證期局預審中，預計12月2 日設立。
2011年7月合庫與交通銀行共同簽署MOU，是合庫繼中國銀行、農業銀行、國家開發銀行，與第4家陸銀簽署MOU，雙方初期將從聯貸及中小企金授信、資金拆借、轉存款、教育訓練等領域展開，長期則會將合作領域拓展到財富管理。
除了大陸市場，合庫申請設立澳洲雪梨分行已獲准，預計2011年9月取得執照，將成為合庫繼香港、馬尼拉、西雅圖、洛杉磯、布魯塞爾、蘇州分行之後的第7個海外據點。
