微控制器支援電路電子印刷電路板總成的主要元件之一,專司硬碟機內的系統維護及控制的機能。目前使用在硬碟機上的可分為Intel的80xxx系列以及Motorola的68xxx系列單晶片控制器,且目前大多的硬碟機電路已經使用大型積體電路所作成的客訂製IC,所以硬碟機的電子電路板上的積體電路電路數目會愈來愈少。